昆山市轨道交通投资发展有限公司（简称“昆山轨道公司”）成立于2009年9月25日，注册资 金7.072亿元。公司下设4个职能部门和1家分公司。昆山轨道公司是昆山交通发展控股有限公司下属全资子公司，主要经营范围为轨道交通工程建设、轨道交 通运输服务、轨道交通项目投资与开发，承担轨道交通工程的投资、建设、管理、运营、开发等职能。

昆山市轨道交通投资发展有限公司运营分公司是昆山轨道公司下属分公司，目前主要负责轨道交通11号线花桥段6公里、3座车站的运营管理工作。